工商部门对违法案件的处罚时间主要取决于案件的复杂性和适用的程序。以下是相关法律规定及处理时限：
工商部门在立案后，一般应在 90日内作出处罚决定。
如果案情复杂，不能在规定期限内作出处理决定的，经工商行政管理机关负责人批准，可以延长 30日。
对于案情特别复杂的案件，经延期仍不能作出处理决定的，应当由工商行政管理机关有关会议集体讨论决定是否继续延期。
对于适用简易程序处理的案件，可以当场作出处罚决定。
工商局对于行政违法案件的立案审查时间是7天，特殊情况下可以延长至15天。
综上所述，工商部门对违法案件的处罚时间一般为90日，但在特殊情况下可以延长至105日（90日+30日+15日）。如果案件特别复杂，可能需要经过工商行政管理机关的集体讨论，并且总的处理时间不得超过两年。
建议：
工商部门在处理案件时应严格按照法律规定进行，确保在法定期限内作出处罚决定，以保障法律程序的正当性和效率。
当事人应密切关注案件的进展情况，并在必要时寻求法律援助，以确保自身权益得到及时有效的保护。
