非法采砂行为应由河道管理部门进行管辖。根据《中华人民共和国河道管理条例》第四十四条的规定，河道管理部门有权对非法采砂行为进行查处，包括责令其纠正违法行为、采取补救措施，并可处以警告、罚款、没收非法所得等措施。
