物流主要是由交通运输管理部门进行管理。具体来说，物流公司的运营受到以下部门的监督和管理：
1. 交通运输管理部门：负责制定和执行物流行业的政策法规，监管物流市场，打击非法经营和不正当竞争行为，维护市场秩序。
2. 公安机关交通管理部门：负责道路交通安全管理工作。
3. 工商管理部门：负责流通领域商品质量的监管、广告发布、商标注册及使用、市场监管、打击传销、企业登记注册及日常监管年检、打击不正当竞争行为、监管市场垄断行为、打击商业贿赂行为、个体工商户登记注册及日常监管、经济合同管理、消费者权益保护等。
4. 商务部门：可能涉及物流行业的促进和指导。
物流公司还需遵守相关法规，如《中华人民共和国道路交通安全法》、《中华人民共和国交通部汽车货物运输规则》、《道路货物运输及站场管理规定》等。
