港澳通行证一年两次的意思是指 在签注有效期内，持证人可以在一年之内入境香港或澳门两次。根据《中华人民共和国出境入境管理法》第十条规定，公民在往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，以及大陆与台湾地区时，应当依法申请办理通行证件，并遵守相关规定。
具体使用上，签注次数在入境时会被扣除，用完之后需要重新续签。例如，如果某人在2023年1月1日获得了“一年两次”的签注，那么他必须在2023年12月31日之前入境香港或澳门两次。如果在这两次入境之后，该签注还有剩余次数，他可以在签注到期前前往出入境部门进行续签，以延长签注的有效期。
需要注意的是，签注的有效期和入境次数是独立的，即使签注还有剩余次数，如果超过了签注的有效期，持证人需要重新办理签注。
